Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd1d1P11609 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cd1d1P11609 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd1d1P11609 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms