Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk1P11440 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cdk1P11440 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk1P11440 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms