Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc6P10629 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxc6P10629 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc6P10629 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxc6P10629 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxc6P10629 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxc6P10629 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxc6P10629 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxc6P10629 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxc6P10629 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc6P10629 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc6P10629 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc6P10629 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc6P10629 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxc6P10629 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxc6P10629 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc6P10629 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxc6P10629 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxc6P10629 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxc6P10629 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc6P10629 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc6P10629 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc6P10629 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms