Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc8P09025 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc8P09025 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc8P09025 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc8P09025 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc8P09025 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc8P09025 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc8P09025 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc8P09025 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc8P09025 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc8P09025 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc8P09025 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc8P09025 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms