Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr2aP08775 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr2aP08775 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr2aP08775 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Polr2aP08775 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Polr2aP08775 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Polr2aP08775 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Polr2aP08775 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Polr2aP08775 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr2aP08775 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr2aP08775 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Polr2aP08775 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Polr2aP08775 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Polr2aP08775 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Polr2aP08775 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr2aP08775 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr2aP08775 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms