Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NefmP08553 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NefmP08553 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NefmP08553 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NefmP08553 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NefmP08553 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NefmP08553 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NefmP08553 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NefmP08553 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NefmP08553 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NefmP08553 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NefmP08553 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NefmP08553 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NefmP08553 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NefmP08553 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NefmP08553 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NefmP08553 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NefmP08553 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NefmP08553 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NefmP08553 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NefmP08553 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NefmP08553 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NefmP08553 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NefmP08553 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NefmP08553 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NefmP08553 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NefmP08553 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NefmP08553 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NefmP08553 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NefmP08553 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NefmP08553 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NefmP08553 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NefmP08553 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NefmP08553 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NefmP08553 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NefmP08553 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NefmP08553 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NefmP08553 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NefmP08553 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NefmP08553 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NefmP08553 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NefmP08553 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NefmP08553 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NefmP08553 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NefmP08553 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NefmP08553 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NefmP08553 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NefmP08553 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NefmP08553 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NefmP08553 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NefmP08553 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NefmP08553 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NefmP08553 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NefmP08553 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NefmP08553 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NefmP08553 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
NefmP08553 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NefmP08553 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NefmP08553 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NefmP08553 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NefmP08553 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NefmP08553 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NefmP08553 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NefmP08553 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NefmP08553 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NefmP08553 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NefmP08553 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
NefmP08553 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NefmP08553 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NefmP08553 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NefmP08553 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NefmP08553 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NefmP08553 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NefmP08553 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NefmP08553 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NefmP08553 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NefmP08553 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NefmP08553 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NefmP08553 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NefmP08553 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NefmP08553 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NefmP08553 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NefmP08553 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NefmP08553 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NefmP08553 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NefmP08553 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NefmP08553 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NefmP08553 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NefmP08553 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NefmP08553 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NefmP08553 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NefmP08553 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NefmP08553 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NefmP08553 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NefmP08553 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NefmP08553 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NefmP08553 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NefmP08553 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NefmP08553 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NefmP08553 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318 ms