Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sod1P08228 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sod1P08228 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sod1P08228 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sod1P08228 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sod1P08228 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sod1P08228 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sod1P08228 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sod1P08228 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sod1P08228 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sod1P08228 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sod1P08228 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sod1P08228 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sod1P08228 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sod1P08228 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sod1P08228 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sod1P08228 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sod1P08228 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sod1P08228 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sod1P08228 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sod1P08228 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sod1P08228 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sod1P08228 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sod1P08228 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sod1P08228 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms