Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgamP05555 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgamP05555 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgamP05555 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgamP05555 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgamP05555 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgamP05555 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgamP05555 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgamP05555 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgamP05555 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgamP05555 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgamP05555 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgamP05555 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgamP05555 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms