Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XlrP05531 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XlrP05531 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XlrP05531 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XlrP05531 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XlrP05531 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
XlrP05531 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XlrP05531 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XlrP05531 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XlrP05531 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XlrP05531 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XlrP05531 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XlrP05531 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XlrP05531 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XlrP05531 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XlrP05531 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XlrP05531 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XlrP05531 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XlrP05531 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XlrP05531 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XlrP05531 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XlrP05531 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XlrP05531 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XlrP05531 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XlrP05531 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XlrP05531 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XlrP05531 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XlrP05531 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XlrP05531 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XlrP05531 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XlrP05531 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XlrP05531 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XlrP05531 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XlrP05531 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XlrP05531 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XlrP05531 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XlrP05531 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XlrP05531 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XlrP05531 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XlrP05531 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XlrP05531 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XlrP05531 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
XlrP05531 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XlrP05531 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XlrP05531 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XlrP05531 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XlrP05531 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XlrP05531 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XlrP05531 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XlrP05531 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XlrP05531 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XlrP05531 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XlrP05531 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XlrP05531 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
XlrP05531 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
XlrP05531 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
XlrP05531 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XlrP05531 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XlrP05531 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XlrP05531 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XlrP05531 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XlrP05531 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XlrP05531 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XlrP05531 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XlrP05531 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XlrP05531 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XlrP05531 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
XlrP05531 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XlrP05531 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XlrP05531 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XlrP05531 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XlrP05531 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XlrP05531 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XlrP05531 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XlrP05531 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XlrP05531 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
XlrP05531 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XlrP05531 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XlrP05531 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XlrP05531 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XlrP05531 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XlrP05531 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XlrP05531 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XlrP05531 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XlrP05531 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XlrP05531 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XlrP05531 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XlrP05531 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XlrP05531 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XlrP05531 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XlrP05531 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XlrP05531 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XlrP05531 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XlrP05531 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XlrP05531 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XlrP05531 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XlrP05531 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XlrP05531 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XlrP05531 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XlrP05531 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.6 ms