Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01740 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01740 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01740 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01740 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01740 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01740 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01740 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P01740 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01740 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01740 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01740 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01740 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01740 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01740 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01740 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
P01740 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01740 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01740 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01740 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01740 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01740 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01740 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01740 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01740 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01740 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01740 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01740 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01740 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01740 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
P01740 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01740 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01740 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01740 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01740 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01740 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01740 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01740 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01740 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01740 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01740 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01740 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01740 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01740 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01740 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01740 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01740 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01740 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01740 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01740 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
P01740 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
P01740 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01740 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01740 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01740 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01740 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01740 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01740 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01740 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01740 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01740 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01740 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01740 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01740 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01740 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01740 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01740 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01740 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01740 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01740 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P01740 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01740 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01740 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01740 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01740 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01740 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01740 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01740 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01740 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01740 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01740 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01740 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01740 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01740 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01740 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01740 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01740 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01740 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01740 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01740 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01740 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
P01740 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01740 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01740 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01740 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01740 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01740 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01740 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01740 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
P01740 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms