Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01735 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01735 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01735 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01735 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
P01735 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01735 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01735 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01735 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01735 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01735 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01735 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01735 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01735 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01735 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01735 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
P01735 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01735 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01735 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01735 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01735 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01735 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01735 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01735 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01735 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01735 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
P01735 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
P01735 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01735 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01735 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01735 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01735 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01735 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01735 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01735 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
P01735 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01735 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01735 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01735 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01735 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01735 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01735 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01735 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01735 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01735 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01735 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01735 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01735 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01735 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01735 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01735 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01735 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01735 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01735 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01735 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01735 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01735 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01735 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
P01735 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
P01735 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
P01735 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
P01735 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
P01735 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
P01735 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
P01735 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
P01735 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01735 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01735 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01735 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01735 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01735 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01735 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
P01735 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P01735 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P01735 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P01735 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P01735 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P01735 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01735 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01735 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01735 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01735 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01735 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01735 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
P01735 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01735 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01735 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01735 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01735 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01735 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P01735 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P01735 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P01735 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P01735 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P01735 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P01735 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P01735 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P01735 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
P01735 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P01735 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms