Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pak1O88643 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pak1O88643 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pak1O88643 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pak1O88643 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pak1O88643 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pak1O88643 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pak1O88643 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pak1O88643 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pak1O88643 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pak1O88643 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pak1O88643 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pak1O88643 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pak1O88643 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pak1O88643 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pak1O88643 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pak1O88643 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pak1O88643 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pak1O88643 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pak1O88643 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pak1O88643 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms