Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AvilO88398 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AvilO88398 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AvilO88398 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AvilO88398 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AvilO88398 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AvilO88398 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AvilO88398 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AvilO88398 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AvilO88398 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AvilO88398 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AvilO88398 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AvilO88398 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AvilO88398 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AvilO88398 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AvilO88398 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AvilO88398 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AvilO88398 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AvilO88398 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AvilO88398 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AvilO88398 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AvilO88398 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AvilO88398 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AvilO88398 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AvilO88398 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AvilO88398 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AvilO88398 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AvilO88398 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AvilO88398 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AvilO88398 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AvilO88398 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AvilO88398 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AvilO88398 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AvilO88398 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AvilO88398 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AvilO88398 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AvilO88398 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AvilO88398 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AvilO88398 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AvilO88398 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AvilO88398 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AvilO88398 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AvilO88398 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AvilO88398 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AvilO88398 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AvilO88398 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AvilO88398 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AvilO88398 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AvilO88398 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AvilO88398 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AvilO88398 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AvilO88398 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AvilO88398 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AvilO88398 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AvilO88398 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AvilO88398 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AvilO88398 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AvilO88398 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AvilO88398 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AvilO88398 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AvilO88398 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AvilO88398 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AvilO88398 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AvilO88398 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AvilO88398 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AvilO88398 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AvilO88398 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AvilO88398 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AvilO88398 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AvilO88398 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AvilO88398 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AvilO88398 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AvilO88398 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
AvilO88398 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AvilO88398 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AvilO88398 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AvilO88398 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AvilO88398 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AvilO88398 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AvilO88398 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AvilO88398 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AvilO88398 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AvilO88398 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AvilO88398 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AvilO88398 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AvilO88398 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AvilO88398 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AvilO88398 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AvilO88398 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AvilO88398 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AvilO88398 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AvilO88398 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AvilO88398 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AvilO88398 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AvilO88398 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AvilO88398 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AvilO88398 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AvilO88398 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AvilO88398 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AvilO88398 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms