Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pknox1O70477 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pknox1O70477 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pknox1O70477 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pknox1O70477 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms