Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HcrtO55241 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HcrtO55241 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HcrtO55241 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HcrtO55241 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HcrtO55241 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HcrtO55241 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HcrtO55241 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HcrtO55241 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HcrtO55241 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HcrtO55241 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HcrtO55241 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HcrtO55241 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HcrtO55241 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HcrtO55241 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HcrtO55241 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HcrtO55241 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HcrtO55241 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HcrtO55241 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HcrtO55241 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HcrtO55241 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HcrtO55241 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HcrtO55241 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HcrtO55241 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HcrtO55241 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HcrtO55241 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms