Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChkbO55229 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChkbO55229 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ChkbO55229 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChkbO55229 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChkbO55229 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkbO55229 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkbO55229 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChkbO55229 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChkbO55229 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms