Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole2O54956 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole2O54956 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole2O54956 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pole2O54956 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole2O54956 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole2O54956 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pole2O54956 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pole2O54956 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pole2O54956 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pole2O54956 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole2O54956 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole2O54956 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole2O54956 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pole2O54956 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole2O54956 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole2O54956 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole2O54956 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole2O54956 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pole2O54956 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms