Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnajb6O54946 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnajb6O54946 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnajb6O54946 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnajb6O54946 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnajb6O54946 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms