Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Smarce1O54941 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarce1O54941 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smarce1O54941 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarce1O54941 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarce1O54941 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarce1O54941 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms