Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rdh16O54909 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh16O54909 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh16O54909 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh16O54909 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rdh16O54909 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh16O54909 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh16O54909 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh16O54909 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rdh16O54909 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rdh16O54909 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rdh16O54909 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rdh16O54909 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rdh16O54909 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdh16O54909 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms