Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf12O54907 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnfsf12O54907 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf12O54907 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms