Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChkaO54804 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChkaO54804 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChkaO54804 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ChkaO54804 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkaO54804 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChkaO54804 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkaO54804 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChkaO54804 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChkaO54804 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChkaO54804 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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