Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnd2O35927 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctnnd2O35927 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctnnd2O35927 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnd2O35927 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnd2O35927 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms