Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf5O35445 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf5O35445 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf5O35445 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms