Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xbp1O35426 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Xbp1O35426 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xbp1O35426 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xbp1O35426 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Xbp1O35426 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xbp1O35426 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms