Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Abcc1O35379 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Abcc1O35379 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Abcc1O35379 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Abcc1O35379 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Abcc1O35379 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Abcc1O35379 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Abcc1O35379 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Abcc1O35379 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Abcc1O35379 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Abcc1O35379 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Abcc1O35379 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Abcc1O35379 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Abcc1O35379 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Abcc1O35379 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Abcc1O35379 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Abcc1O35379 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Abcc1O35379 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Abcc1O35379 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms