Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema4dO09126 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema4dO09126 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema4dO09126 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sema4dO09126 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4dO09126 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms