Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NumblO08919 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NumblO08919 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NumblO08919 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NumblO08919 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NumblO08919 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NumblO08919 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NumblO08919 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NumblO08919 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NumblO08919 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NumblO08919 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NumblO08919 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NumblO08919 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NumblO08919 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NumblO08919 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NumblO08919 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NumblO08919 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NumblO08919 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NumblO08919 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NumblO08919 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NumblO08919 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NumblO08919 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NumblO08919 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NumblO08919 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NumblO08919 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NumblO08919 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NumblO08919 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NumblO08919 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NumblO08919 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NumblO08919 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NumblO08919 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NumblO08919 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NumblO08919 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NumblO08919 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NumblO08919 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NumblO08919 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NumblO08919 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NumblO08919 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NumblO08919 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NumblO08919 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NumblO08919 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NumblO08919 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NumblO08919 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NumblO08919 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NumblO08919 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NumblO08919 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NumblO08919 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NumblO08919 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NumblO08919 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NumblO08919 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NumblO08919 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NumblO08919 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NumblO08919 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NumblO08919 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NumblO08919 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NumblO08919 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NumblO08919 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NumblO08919 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NumblO08919 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NumblO08919 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NumblO08919 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NumblO08919 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NumblO08919 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NumblO08919 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NumblO08919 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NumblO08919 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NumblO08919 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NumblO08919 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NumblO08919 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NumblO08919 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NumblO08919 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NumblO08919 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NumblO08919 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NumblO08919 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NumblO08919 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NumblO08919 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NumblO08919 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NumblO08919 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NumblO08919 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NumblO08919 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NumblO08919 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NumblO08919 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NumblO08919 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NumblO08919 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NumblO08919 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NumblO08919 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NumblO08919 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NumblO08919 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NumblO08919 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NumblO08919 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NumblO08919 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NumblO08919 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NumblO08919 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NumblO08919 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NumblO08919 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NumblO08919 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NumblO08919 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NumblO08919 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NumblO08919 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NumblO08919 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms