Protein–RNA interactions for Protein: O08792

Ebf2, Transcription factor COE2, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf2O08792 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ebf2O08792 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ebf2O08792 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ebf2O08792 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ebf2O08792 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ebf2O08792 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ebf2O08792 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ebf2O08792 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ebf2O08792 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ebf2O08792 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ebf2O08792 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ebf2O08792 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ebf2O08792 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ebf2O08792 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ebf2O08792 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms