Protein–RNA interactions for Protein: O08740

Polr2j, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2jO08740 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2jO08740 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr2jO08740 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2jO08740 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2jO08740 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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