Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn2O08529 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Capn2O08529 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Capn2O08529 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Capn2O08529 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Capn2O08529 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn2O08529 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn2O08529 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn2O08529 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn2O08529 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Capn2O08529 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Capn2O08529 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn2O08529 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn2O08529 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn2O08529 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Capn2O08529 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms