Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam240aJ3QNP9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam240aJ3QNP9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam240aJ3QNP9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam240aJ3QNP9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam240aJ3QNP9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam240aJ3QNP9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam240aJ3QNP9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam240aJ3QNP9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam240aJ3QNP9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam240aJ3QNP9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam240aJ3QNP9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam240aJ3QNP9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam240aJ3QNP9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam240aJ3QNP9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam240aJ3QNP9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam240aJ3QNP9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam240aJ3QNP9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam240aJ3QNP9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam240aJ3QNP9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam240aJ3QNP9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam240aJ3QNP9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam240aJ3QNP9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam240aJ3QNP9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam240aJ3QNP9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms