Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm21411J3KMS0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21411J3KMS0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21411J3KMS0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21411J3KMS0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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