Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ScaperF8VQ70 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ScaperF8VQ70 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ScaperF8VQ70 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ScaperF8VQ70 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ScaperF8VQ70 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ScaperF8VQ70 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms