Protein–RNA interactions for Protein: F6VYM1

Lrrc31, Leucine-rich repeat-containing 31 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc31F6VYM1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc31F6VYM1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc31F6VYM1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc31F6VYM1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc31F6VYM1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc31F6VYM1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc31F6VYM1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc31F6VYM1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc31F6VYM1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc31F6VYM1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc31F6VYM1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc31F6VYM1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc31F6VYM1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc31F6VYM1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc31F6VYM1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc31F6VYM1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc31F6VYM1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms