Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8247F6VRJ8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm8247F6VRJ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm8247F6VRJ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm8247F6VRJ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm8247F6VRJ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms