Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc74aE9Q9U8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc74aE9Q9U8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc74aE9Q9U8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 765.5 ms