Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga10E9Q6R1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga10E9Q6R1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga10E9Q6R1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga10E9Q6R1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms