Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ythdc1E9Q5K9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ythdc1E9Q5K9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ythdc1E9Q5K9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ythdc1E9Q5K9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ythdc1E9Q5K9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ythdc1E9Q5K9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ythdc1E9Q5K9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ythdc1E9Q5K9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ythdc1E9Q5K9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ythdc1E9Q5K9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc1E9Q5K9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ythdc1E9Q5K9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ythdc1E9Q5K9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ythdc1E9Q5K9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ythdc1E9Q5K9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms