Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Susd1E9Q3H4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd1E9Q3H4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Susd1E9Q3H4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd1E9Q3H4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms