Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
5430401F13RikE9Q328 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5430401F13RikE9Q328 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
5430401F13RikE9Q328 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5430401F13RikE9Q328 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms