Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm4450E9Q007 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm4450E9Q007 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm4450E9Q007 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm4450E9Q007 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm4450E9Q007 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm4450E9Q007 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms