Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcom1E9PZ54 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gcom1E9PZ54 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gcom1E9PZ54 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gcom1E9PZ54 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms