Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
Rsph10bE9PYQ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rsph10bE9PYQ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rsph10bE9PYQ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rsph10bE9PYQ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rsph10bE9PYQ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rsph10bE9PYQ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Rsph10bE9PYQ0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Rsph10bE9PYQ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Rsph10bE9PYQ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Rsph10bE9PYQ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rsph10bE9PYQ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,68
Rsph10bE9PYQ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Rsph10bE9PYQ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Rsph10bE9PYQ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms