Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam46aD3Z5S8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam46aD3Z5S8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam46aD3Z5S8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fam46aD3Z5S8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46aD3Z5S8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms