Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem200bD3Z0P8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmem200bD3Z0P8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms