Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3259D3YUK0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gm3259D3YUK0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3259D3YUK0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3259D3YUK0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3259D3YUK0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3259D3YUK0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3259D3YUK0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3259D3YUK0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3259D3YUK0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms