Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Siah3B2RWG3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Siah3B2RWG3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah3B2RWG3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah3B2RWG3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Siah3B2RWG3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms