Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apba1B2RUJ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba1B2RUJ5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Apba1B2RUJ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apba1B2RUJ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms