Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pramef20B1ARV6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pramef20B1ARV6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef20B1ARV6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef20B1ARV6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef20B1ARV6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms